Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace1P56818 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bace1P56818 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace1P56818 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Bace1P56818 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bace1P56818 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bace1P56818 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bace1P56818 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bace1P56818 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bace1P56818 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms