Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdcd5P56812 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms