Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp2c40P56657 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c40P56657 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms