Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc1a3P56564 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a3P56564 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms