Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lim2P56563 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lim2P56563 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lim2P56563 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lim2P56563 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lim2P56563 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lim2P56563 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms