Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf5P56477 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf5P56477 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf5P56477 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf5P56477 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf5P56477 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf5P56477 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Irf5P56477 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf5P56477 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf5P56477 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf5P56477 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf5P56477 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf5P56477 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf5P56477 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf5P56477 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf5P56477 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf5P56477 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms