Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp5P56399 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp5P56399 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp5P56399 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp5P56399 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp5P56399 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp5P56399 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms