Protein–RNA interactions for Protein: P56390

Cks2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks2P56390 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cks2P56390 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cks2P56390 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms