Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacnb3P54285 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacnb3P54285 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms