Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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