Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Upp1P52624 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp1P52624 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp1P52624 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms