Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClgnP52194 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms