Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa8P50706 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa8P50706 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa8P50706 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa8P50706 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa8P50706 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms