Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc13P50207 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms