Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpreP49446 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpreP49446 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms