Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms