Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn3P48299 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms