Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms