Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr7P47774 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr7P47774 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms