Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt1P46096 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt1P46096 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt1P46096 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt1P46096 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt1P46096 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt1P46096 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syt1P46096 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms