Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgavP43406 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ItgavP43406 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgavP43406 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgavP43406 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms