Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd9P40240 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd9P40240 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd9P40240 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd9P40240 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd9P40240 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd9P40240 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd9P40240 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms