Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csf3rP40223 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.1 ms