Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col18a1P39061 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms