Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddit3P35639 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms