Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin1P35438 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin1P35438 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin1P35438 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin1P35438 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin1P35438 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin1P35438 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin1P35438 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grin1P35438 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms