Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpardP35396 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpardP35396 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpardP35396 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpardP35396 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpardP35396 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpardP35396 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpardP35396 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpardP35396 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpardP35396 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpardP35396 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpardP35396 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpardP35396 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpardP35396 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpardP35396 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpardP35396 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpardP35396 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpardP35396 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpardP35396 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpardP35396 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpardP35396 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpardP35396 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpardP35396 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpardP35396 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpardP35396 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PpardP35396 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpardP35396 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpardP35396 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpardP35396 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpardP35396 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpardP35396 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpardP35396 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpardP35396 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpardP35396 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpardP35396 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpardP35396 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpardP35396 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpardP35396 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpardP35396 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpardP35396 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpardP35396 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpardP35396 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpardP35396 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpardP35396 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpardP35396 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpardP35396 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpardP35396 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpardP35396 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpardP35396 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpardP35396 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpardP35396 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PpardP35396 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms