Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab17P35292 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab17P35292 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab17P35292 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms