Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab5cP35278 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5cP35278 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5cP35278 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5cP35278 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5cP35278 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5cP35278 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5cP35278 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab5cP35278 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5cP35278 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5cP35278 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5cP35278 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5cP35278 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5cP35278 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5cP35278 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5cP35278 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab5cP35278 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab5cP35278 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab5cP35278 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab5cP35278 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab5cP35278 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5cP35278 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5cP35278 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5cP35278 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5cP35278 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5cP35278 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5cP35278 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5cP35278 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5cP35278 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5cP35278 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5cP35278 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5cP35278 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms