Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ifnar1P33896 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifnar1P33896 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms