Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KrasP32883 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KrasP32883 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KrasP32883 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KrasP32883 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KrasP32883 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KrasP32883 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KrasP32883 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KrasP32883 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KrasP32883 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KrasP32883 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KrasP32883 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KrasP32883 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KrasP32883 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KrasP32883 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KrasP32883 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KrasP32883 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KrasP32883 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KrasP32883 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KrasP32883 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KrasP32883 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KrasP32883 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KrasP32883 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KrasP32883 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms