Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gsx2P31316 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx2P31316 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx2P31316 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx2P31316 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx2P31316 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx2P31316 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx2P31316 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx2P31316 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx2P31316 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsx2P31316 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms