Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc11P31313 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms