Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msr1P30204 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msr1P30204 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msr1P30204 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msr1P30204 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Msr1P30204 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msr1P30204 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms