Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcdP28867 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms