Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GrnP28798 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GrnP28798 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GrnP28798 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GrnP28798 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GrnP28798 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GrnP28798 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GrnP28798 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GrnP28798 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GrnP28798 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GrnP28798 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GrnP28798 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GrnP28798 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GrnP28798 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GrnP28798 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GrnP28798 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GrnP28798 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GrnP28798 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms