Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BgnP28653 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BgnP28653 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BgnP28653 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BgnP28653 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BgnP28653 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BgnP28653 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BgnP28653 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BgnP28653 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BgnP28653 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BgnP28653 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BgnP28653 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BgnP28653 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BgnP28653 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BgnP28653 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BgnP28653 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BgnP28653 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BgnP28653 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BgnP28653 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BgnP28653 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BgnP28653 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BgnP28653 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BgnP28653 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BgnP28653 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BgnP28653 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BgnP28653 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BgnP28653 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BgnP28653 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BgnP28653 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BgnP28653 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms