Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LoxP28301 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LoxP28301 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LoxP28301 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LoxP28301 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LoxP28301 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LoxP28301 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LoxP28301 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LoxP28301 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LoxP28301 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LoxP28301 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LoxP28301 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LoxP28301 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LoxP28301 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LoxP28301 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms