Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjc1P28229 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms