Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vav1P27870 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vav1P27870 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vav1P27870 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vav1P27870 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vav1P27870 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vav1P27870 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vav1P27870 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms