Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af2P26369 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.27■■□□□ 1
U2af2P26369 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af2P26369 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af2P26369 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
U2af2P26369 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af2P26369 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
U2af2P26369 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
U2af2P26369 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af2P26369 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af2P26369 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af2P26369 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af2P26369 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
U2af2P26369 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af2P26369 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af2P26369 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U2af2P26369 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms