Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChgaP26339 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChgaP26339 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChgaP26339 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChgaP26339 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChgaP26339 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChgaP26339 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms