Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms