Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja1P23242 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja1P23242 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja1P23242 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja1P23242 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms