Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tap1P21958 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tap1P21958 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.4 ms