Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxb9P20615 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb9P20615 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms