Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P20040 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P20040 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P20040 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P20040 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P20040 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P20040 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P20040 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P20040 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P20040 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P20040 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P20040 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P20040 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P20040 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P20040 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P20040 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P20040 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P20040 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P20040 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P20040 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P20040 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P20040 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P20040 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P20040 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P20040 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms