Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox5bP19536 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox5bP19536 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox5bP19536 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox5bP19536 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox5bP19536 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox5bP19536 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox5bP19536 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox5bP19536 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox5bP19536 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms