Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a1P19437 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a1P19437 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms