Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18532 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18532 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18532 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18532 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18532 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P18532 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18532 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18532 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18532 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18532 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18532 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18532 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18532 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18532 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18532 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18532 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18532 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18532 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18532 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18532 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18532 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18532 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18532 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms